iSpartan
iOS Universel / Productivité
iSpartan est une application versatile pour la modélisation moléculaire sur iPad et iPhone L’application permet à tout chimiste un accès facile et rapide à des méthodes calculatoires validées sur un grand nombre de molécules.
Les molécules sont crées a partir d’un dessin en deux dimensions de la structure, similaire à ce qui serait dessiné sur une feuille de papier. L’application convertit le dessin en deux dimensions en une structure tridimensionnelle. Les conformations de basse énergie peuvent être alors calculées et leurs géométries sont interrogeables. Une base de données de 5000 molécules (extrait de la base de donnée SSPD, Spartan Spectra and Properties Database) peut de plus être interrogée pour obtenir les spectres de spectroscopie RMN et infrarouge, les orbitales moléculaires, les cartes de potentiel électrostatique, ainsi que d’autres propriétés atomiques et moléculaires. La base donnée est interrogeable par sous-structures.
Analyse conformationelle:
•Identification du conformère le plus stable
•Investigation des conformations alternatives
•Présentation des résultats dans un diagramme énergétique facilement compréhensible.
iSpartan utilise le champ de force empirique bien validé MMFF et exécute la recherche conformationelle en temps réel.
Propriétés disponibles pour toute molécule :
•Chiralité R/S
•Masse moléculaire
•Superficie totale et superficie polaire
•Volume moléculaire
•Log P
•Constantes de couplage vicinales
•Distance, angles et angles de torsion.
Les spectres et les autres propriétés calculées à partir des méthodes quantiques sont disponibles pour les 5 000 molécules dans la base de donnée incluse avec iSpartan. Pour toute autre molécule, les calculs de chimie quantique peuvent être effectués si le program Spartan Parallel est installé (produit diffèrent, disponible pour les plateformes Windows et Macintosh). Le lien vers Spartan Parallel permet également l’accès a la totalité de la base de données SSPD (environ 250 000 molécules) via l’iPad ou l’iPhoe.
Spectroscopie RMN :
•Attribution des pics proton et carbone
•Confirmation ou invalidation des prédictions de structure
•Suggestion de la structure la plus compatible avec les données
•Exploration et investigation de structures alternatives.
iSpartan inclut les résultats de calculs de la fonctionnelle de la densité (modèle EF2/6-31G*) avec une correction empirique pour l’obtention de spectres très précis. Contrairement aux approches purement empiriques, iSpartan inclut toujours explicitement la structure tridimensionnelle (stéréochimie) et la conformation.
Thermochimie :
•Identification du meilleur tautomère ou isomère
•Evaluation de la distribution des produits a l’équilibre
•Classifications des réactions comme endothermiques ou exothermiques
iSpartan calcule l’énergie totale a partir de calculs DFT. La chaleur de formation de la plupart des molécules organique peut également être estimée en utilisant l’approche très précise T1.
Spectroscopie Infra-Rouge
•Attribution des bandes aux groupes fonctionnels correspondants
•Confirmation ou invalidation des prédictions de structures
•Animation des vibrations moléculaires associes aux bandes d’absorption.
Le spectre est base sur des calculs DFT et inclut a facteur d’échelle pour les fréquences. Les effets de température sont reproduits par une augmentation de la largeur des bandes d’absorption. Le résultat est un spectre précis et réaliste, et similaire aux données expérimentales.
Orbitales Moléculaires et cartes de potentiels électrostatique :
•Analyse des orbitales de frontière pour prédire l’activité moléculaire.
•Utilisation des cartes de potentiel électrostatique pour évaluer la sélectivité, la réactivité, et le potentiel d’acidité et pour différencier les régions polaires (hydrophiles) et non-polaires (hydrophobes).
Autre propriétés calculées :
•Charge atomique partielle
•Moment dipolaire
iSpartan: une plus grande productivité dans la recherche grâce a la modélisation moléculaire.
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