Après l’App Store, c’est au tour d’Apple Pay de se retrouver dans le viseur des instances européennes. Selon un rapport de MLex, la Commission européenne estimerait en effet qu’Apple privilégierait son service de paiement sur sa plateforme tout en freinant, voire empêchant les services concurrents. En effet, Apple interdit aux autres services de paiement de faire usage du NFC des iPhone en relation avec l’app Wallet, ce qui donnerait un avantage compétitif de facto pour Apple Pay, ce dernier étant parfaitement intégré à iOS. A contrario, les commissaires européens notent qu’Android ouvre grand l’accès au NFC des smartphones équipés, sans contraintes spécifiques (autres que celles liées à la sécurité des données).

En conséquence, Apple est soupçonné par la Commission de « possibles pratiques anti-compétitives et de conduite abusive ». Afin d’étayer son enquête, l’équipe de Margrethe Vestager recueillerait le maximum de données concernant « le comportement des acteurs du secteur des paiements, incluant les paiements mobiles ». Si Apple Pay ne représente toujours pas grand chose dans le chiffre d’affaires de d’Apple, la croissance du service aurait déjà dépassé celle de PayPal.